सिप्रोफ्लोक्सासिन क्विनोलोन वर्ग से संबंधित है और एंटरोबैक्टर, स्यूडोमोनास एरुगिनोसा, हीमोफिलस इन्फ्लुएंजा, नाइसेरिया गोनोरिया, स्ट्रेप्टोकोकस, लेगियोनेला और स्टैफिलोकोकस ऑरियस जैसे जीवाणुओं के खिलाफ जीवाणुरोधी प्रभाव रखता है। सिप्रोफ्लोक्सासिन में व्यापक स्पेक्ट्रम जीवाणुरोधी गतिविधि और अच्छा जीवाणुनाशक प्रभाव होता है। लगभग सभी जीवाणुओं के खिलाफ इसकी जीवाणुरोधी गतिविधि नॉरफ्लोक्सासिन और एनोक्सासिन की तुलना में 2 से 4 गुना अधिक मजबूत है।